10月7日，我院以第一作者单位在国际顶刊《柳叶刀-微生物》发表论著《中国多耐药热带念珠菌的区域性扩散与适应性进化：一项回顾性多中心基因组研究》（Regional expansion and adaptive evolution of multidrug-resistant Candida tropicalis in China: a retrospective, multicentre, genomic study）。
本研究由我院检验科（南院）主任吴文娟教授、检验科（南院）医疗主管郭建副主任技师，以及上海交通大学医学院公共卫生学院刘宁宁教授作为共同通讯作者；第一作者分别是朱晨迪博士、张旻博士、万菲菲硕士。该研究由我院南院检验科、病原体-宿主相互作用教育部重点实验室、香港中文大学公共卫生学院、新加坡国家传染病中心传染病研究实验室、上海交通大学医学院公共卫生学院等多家单位合作完成。《柳叶刀-微生物》（The Lancet Microbe）是柳叶刀（The Lancet）旗下侧重微生物领域的子刊，最新影响因子21.9。
抗真菌药物耐药的热带念珠菌（Candida tropicalis）的出现对人类健康和临床管理构成了严重威胁，但其在医院环境中耐药性及持续存在的分子流行病学特征和机制仍不明确。研究旨在研究多重耐药（MDR）热带念珠菌扩散相关的区域性流行病学特征、临床影响及适应性特征。
吴文娟教授团队对中国东部84家医院2017–2024年间临床分离的热带念珠菌进行了回顾性监测研究，并纳入了A医院主动监测中额外发现的多重耐药（MDR，即同时对唑类和棘白菌素类耐药）分离株。分析了A医院的临床数据以识别多重耐药分离株检出及30天死亡率的风险因素。
通过全基因组测序、RNA-seq、表型实验和实验性进化研究，阐明了耐药机制、毒力动态变化及适应性特征。在1,186株分离株中，356株（30.1%）对唑类耐药，100株（8.4%）为多重耐药。
研究发现一种多重耐药热带念珠菌谱系DST849在区域内广泛传播，该谱系主要从泌尿道分离，占所有多重耐药病例的96%。插管是多重耐药菌株分离的关键风险因素（校正后比值比aOR 32.30，95%置信区间CI 10.28–101.45）。多变量逻辑回归分析显示，多重耐药热带念珠菌的分离是30天死亡率的独立预测因子（aOR 2.84，95% CI 1.31–6.16；p=0.0081）。
系统基因组分析表明，多重耐药分离株由唑类耐药祖先谱系（DST225）通过获得FKS1突变（S30P）演化而来，同时保留了ERG11突变（Y132F/S154F）。临床多重耐药分离株表现出增强的应激耐受能力，可能有助于其在临床环境中的持续存在。实验性进化从一株唑类耐药分离株成功获得了稳定的多重耐药衍生株，揭示了一种表型权衡：系统性毒力减弱，但与持续存在相关的特性增强，包括生物膜形成能力提高、Hog1通路持续激活以及渗透压耐受性改善。
该研究揭示了谱系特异性扩增导致多重耐药热带念珠菌出现，其驱动力在于遗传可塑性和适应性应激反应，其在医院环境中持续存在的基础是生物膜形成能力增强和应激韧性。这些发现凸显了加强抗真菌药物管理、开展靶向基因组监测以及采取干预措施减轻多重耐药真菌威胁的紧迫性。（南院检验科）
The Lancet Microbe原文链接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666524726001643#fig1