上海市干细胞临床诊疗工程研究中心（以下简称中心）依托上海市东方医院（同济大学附属东方医院），于2019年7月3日获上海市发改委批复建设，系首批12家上海市工程研究中心之一。
中心面向国家重大战略任务和社会发展需要，以人类重大疾病诊疗为牵引，开展干细胞关键技术攻关和临床研究及干细胞重大科技成果的工程化实验验证，拟实现干细胞临床转化与应用关键技术突破，旨在建设成为上海（国家）干细胞科创中心重要功能平台和我国生物医药领域创新发展的重大科学基础设施。
中心主要聚焦“临床级干细胞规模化标准化制备与分化体系建设”“干细胞制剂新型快速质检体系构建”“干细胞临床前研究大动物实验平台建设”“干细胞体内命运转归研究平台建设”“干细胞临床诊疗转化与应用平台建设”等5项重点任务，开展干细胞及转化研究，以期在干细胞关键技术研发平台建设、干细胞临床转化与应用基地建设、人才与创新体制机制建设等方面取得突破。
中心以提升生物医药产业整体研发和产业化竞争优势为使命，以加强科研成果向实际生产力转化为核心，加速驱动生物医药产业转型发展和干细胞临床诊疗转化与应用，助推上海打造领跑国际干细胞产业领域的新高地，助力上海建设具有全球影响力的科技创新中心和“健康中国2030”国家战略，推动健康科技创新，构建国家医学科技创新体系。
